Rozkaz 66 był najbardziej niesławnym poleceniem wydanym w Gwiezdne Wojny historii, sygnalizując koniec Republiki Galaktycznej i początek bliskiego upadku Zakonu Jedi. Podczas gdy żołnierze klonów zostali zmuszeni do posłuszeństwa Rozkazowi 66 ze względu na wszczepione im w kanonie biochipy, Karen Traviss Legendy seria Komandos Republiki maluje znacznie ciemniejszy portret jego wykonania.
Komandos Republiki Seria przedstawia Rozkaz 66 jako polecenie, którego uczono wszystkich żołnierzy-klonów, a nie polecenie, którego byli zmuszeni przestrzegać. Na pierwszy rzut oka Zakon wydawał się całkowicie rozsądny, ponieważ został pierwotnie stworzony przez Sifo-Dyasa jako sposób na pokonanie zbuntowanego Jedi, który wystąpił przeciwko Republice. Rozkaz ten był również wyższy od Rozkazu 65, który miał na celu obalenie Najwyższego Kanclerza, gdyby pojawiła się podobna kwestia.
W Republic Commando: Prawdziwe kolory, Rozkaz 66 jest opisany w następujący sposób: „W przypadku oficerów Jedi działających przeciwko interesom Republiki i po otrzymaniu konkretnych rozkazów zweryfikowanych jako pochodzące bezpośrednio od Naczelnego Dowódcy (Kanclerza), dowódcy GAR usuną tych oficerów śmiertelną siłą i Dowództwo GAR powróci do Naczelnego Dowódcy (Kanclerza) do czasu ustanowienia nowej struktury dowodzenia”.
Traviss przedstawia brutalną rzeczywistość Wojen Klonów, które stworzyły wiele napięć między Żołnierze klonów i ich dowódcy Jedi. Zasadniczo wyhodowany jako żołnierze-niewolnicy dla Republiki, życie żołnierza-klona było w zasadzie podobne do życia droida. Ich przyspieszony proces starzenia zapewnił, że żołnierze klonów nigdy nie osiągną satysfakcjonującego życia poza walką, mimo że klony były biologicznie identyczne z ludźmi i zdolne do biologicznego rozmnażania. Klony były również zdolne do pełnego zakresu ludzkich emocji, co wywołało wewnętrzny zamęt związany z ich krótkim istnieniem.
Wielu żołnierzy-klonów również zmęczyło się, gdy wojna się przeciągała, ponieważ byli zmuszeni patrzeć, jak ich bracia padają w bitwie. Komandos Republiki: Rozkaz 66 szczegółowo opisuje wewnętrzne frustracje komandosa oddziału Delta Scorcha w związku z tą utratą życia, gdy słyszy imiona tysięcy poległych żołnierzy-klonów. — Scorch nie potrafił teraz wymienić połowy oddziałów ze swojej grupy w ośrodku szkoleniowym Tipoca, nie mówiąc już o mężczyznach w nich. Wstydził się, jakby ich zdradził” – czytamy w fragmencie. Gdy wojna się przeciągała, wielu żołnierzy-klonów zaczęło żywić urazę do Jedi z powodu tych strat, nawet poddając w wątpliwość ich kompetencje.
Nastawienie Jedi do żołnierzy-klonów nie było lepsze, ponieważ postrzegali ich jedynie jako jednorazowe. Byli szczególnie obojętni na komandosów klonów, których uważali za usankcjonowanych przez państwo łowców nagród dla Republiki. Pomimo obojętności wobec tych oddziałów, Jedi rozumieli ich konieczność w czasie wojny. — Na tym polega problem z inteligentnymi klonami szkolonymi przez łachmana niezdyscyplinowanych bandytów — okazały się w najlepszym razie idiosynkratyczne, w najgorszym nieposłuszne. Ale prawdopodobnie wygrają dla nas wojnę. Toleruj ich” – wyjaśnił mistrz Jedi i dyrektor sił specjalnych generał Arligan Zey Komandos Republiki: potrójne zero .
W wyniku tego wspólnego niezadowolenia wielu żołnierzy-klonów nie było trudno skierować broń na byłych dowódców, ale pozostało kilka godnych uwagi odstających. Ion Team dowodzony przez kapitana Climbera nie tylko nie posłuchał rozkazu, ale skierował broń przeciwko siłom komandora Salvo, który próbował zaatakować grupę Jedi. Inne eskadry klonów, takie jak Oddział Omega, Oddział Delta i Ordo Skirata, również nie posłuchały rozkazu, ale udawały, że podporządkowują się, aby uniknąć podejrzeń ze strony Imperium. Podczas gdy klony w tych ostatnich eskadrach utrzymywały słabe relacje z Jedi, byli znacznie bardziej sceptyczni wobec Palpatine'a, który ujawnił nowe klony Centax, które normalnie się starzeją.
Podczas gdy kanon pozbawia Klony ich winy w wykonaniu Rozkazu 66, Legendy konfrontuje się z ich zdradą. Ten niuansowy obraz Rozkazu 66 jest ciemniejszy niż kanon, ale Komandos Republiki zapewnia głębię jego egzekucji, humanizując swoich klonów sprawców i ich cierpienie.
